Det er statens pulje til sundheds- og akutløsninger i yderområder i Danmark, der har finansieret de to nye sundhedshuse til 10 millioner kroner. På Fyn er der i forvejen sundhedshuse i Rudkøbing og Bogense.
Sundhedshusene på Ærø skal ligesom de øvrige sundhedshuse skabe sammenhæng mellem kommunale og regionale tilbud og lokke læger til yderområderne.
I Ærøskøbing er er der i sundhedshuset kommunale genoptræning, hjemmesygepleje og sundhedspleje med den regionale socialpsykiatri og misbrugsbehandling. Derudover er der en hal til genoptræning.
I Marstal er det det gamle rådhus, der nu bliver sundhedshus. Her bliver der plads til tre praktiserende læger, en sygeplejeklinik, en fodterapeut og to praktiserende fysioterapeuter.