Manden blev fremstillet ved retten i Svendborg, som omgående lukkede dørene for offentligheden.
Den 27-årige danske statsborger med palæstinensisk baggrund blev varetægtsfængslet i fire uger.
Før lukningen kom det frem, at manden nægter sig skyldig, men at han erkender at have haft en pistol.
Den 27-årige meldte sig selv torsdag morgen som ejer af den sorte Audi, vidner så stikke af fra Rosengårdcentret efter skyderiet.
Skyderiet fandt sted onsdag eftermiddag, da en mand kom ind i Rosengårdcentrets Gul Gade og affyrede adskillige skud mod de to israelere, som havde en stand med salg af hårplejemidler.
Den ene israeler blev ramt i armen, den anden i benet.
Sagen har vakt international opsigt på baggrund af de igangværende kampe mellem israelske og palæstinensere i Gaza.
Derfor følger PET sagen nøje, og hensynet til fremmede magter - herunder Israel - var en af begrundelserne for at lukke grundlovsforhøret foruden hensynet til den videre efterforskning.