Det nye logo er udvalgt blandt flere forskellige logoer, som klubsamarbejdet har haft til diskussion.
Logoet læner sig op af et tidligere forslag og er bygget op omkring klubbernes farver gul, blå og rød. Fyn indgår både som tekst og visuelt element.
Først omkring 1. juni regner FC FYN med at kunne præsentere klubsamarbejdets nye spillerdragter og holdets nye træner og direktør.