Angriberen Uffe Troensegaard bragte svendborgenserne foran efter 18 minutters spil.
Senere i første halvleg bragte forsvareren Jesper Mikkelsen Svendborg yderligere foran til 2-0, som også var pausestillingen.
I kampens 56. minut var det angriberen Andreas Rolskov, som var på pletten for Svendborg.
Med ti minutter tilbage af kampen fik Aarup reduceret til kampens resultat 3-1.
Aarup har nu kun et point efter fem kampen, mens Svendborg med sejren har seks point.